1653年，推动制定了《喀尔喀—卫拉特法典》的卫拉特绰罗斯部首领巴图尔去世，巴图尔也被称为准噶尔部第一任首领。
随后他的第五个儿子僧格继承了洪台吉之位，即准噶尔部第二任首领。
但是1670年，僧格又被同父异母的大哥和二哥联合反叛，遭到暗杀。巴图尔的遗孀即僧格的生母立即派人前往西藏，让在拉萨学习佛法的幼子噶尔丹速速还俗归乡，继承绰罗斯部洪台吉之位。
噶尔丹出生于1644年，正是大明帝国灭亡之年。传说在他出生的时候，曾天降祥瑞，天空中出现了五色祥云，他的父亲巴图尔闻之大喜，认为这个孩子将来绝非等闲之辈。
不久之后，又有西藏高僧来到绰罗斯，认为噶尔丹就是当年应达赖派遣前往卫拉特，向卫拉特四部求援的咱巴呼图克图的转世灵童。于是向巴图尔提议把年幼的噶尔丹带到西藏，让他师从四世班禅和五世达赖学习佛法。自此年幼的噶尔丹便离开了漠西蒙古前往了西藏。
当来自绰罗斯的族人在拉萨找到噶尔丹时，此时的他已经是一个26岁的壮年男子了。他听闻自己的亲哥哥已被异母的大哥和二哥杀害，母亲和族人危在旦夕，立即答应了母亲的要求，
向其师傅五世达赖喇嘛罗桑嘉措和西藏执政官（第巴）桑结嘉措辞行，并得到了两人的许可，达赖喇嘛临行还授予了他“丹津博硕克图”的头衔，让他回乡夺回台吉之位。
噶尔丹回到家乡后，立即召集了哥哥僧格的残部数千人，亲自率兵攻打叛军，并最终杀死了大哥，二哥则兵败逃往青海。噶尔丹顺利继位绰罗斯洪台吉，成为了准噶尔部第三任首领。
而另一边，在当年固始汗动身征服青藏、并在西藏定居成立和硕特政权之后，整个漠西卫拉特蒙古的大汗之位空缺了十年之久。直到1646年，和硕特部的鄂齐尔图车臣汗才被推举为新的卫拉特蒙古大汗。
在噶尔丹成为绰罗斯洪台吉后，势力逐渐强大。由于他常年居住在西藏，并没有在蒙古生活过多久，所以他毫不在乎所谓的《喀尔喀—卫拉特法典》，在他的心里，征服其他弱小的蒙古部落，建立一个统一的蒙古国，才是他的最终目标。于是他不断要求卫拉特其他各部归顺自己，先后招纳了杜尔伯特部的阿勒达尔台吉，和硕特部的丹津洪台吉，土尔扈特部的衮布台吉等人。
噶尔丹的这种扩张行为违反了《喀尔喀—卫拉特法典》中不得侵犯盟友的规定，也引起了卫拉特蒙古大汗—鄂齐尔图车臣汗的恐慌，在1675年，鄂齐尔图车臣汗以卫拉特联盟盟主的身份起兵讨伐噶尔丹，结果很快被势头正盛的噶尔丹击败，被迫在1676年初冬也向其投降。
噶尔丹此时已基本控制了卫拉特蒙古全境，大权在握的他宣布取消过去那种松散的、各自为政的卫拉特联盟制度。并取消了洪台吉、台吉、济农、克什（太师）等头衔，将卫拉特蒙古各部的权力完全集中在自己手里，从而完成了部落联盟制度向国家集权制度的转变。
1678年，看到爱徒已经控制了整个漠西蒙古，五世达赖派使者向其授予“博硕克图汗”的尊号，噶尔丹在准噶尔本部举行了隆重的称汗仪式，卫拉特蒙古自和硕特汗国之后又一个政权—准噶尔汗国诞生了。
而在西藏方面，五世达赖喇嘛和西藏执政官桑杰嘉措一直在关注着准噶尔的动向，他们在向噶尔丹派去使臣的同时，又秘密的建议他出兵攻打青海和西藏，推翻统治青藏的和硕特政权。
前面第6集我们讲到和硕特汗国成立时就已提过，和硕特政权表面上是由黄教掌管的政教合一政权，实际上当时年轻的五世达赖喇嘛，只是由固始汗推到前台的傀儡罢了。青藏地区的真正统治者乃是掌握军权的固始汗及其子孙们。
所以再结合噶尔丹年幼就被接到西藏学法，师从五世达赖喇嘛，壮年重回漠西取得汗位，这一切或许都是黄教在和硕特汗国成立时就已谋划下的一盘大棋。
书归正传，在噶尔丹收到师傅的秘密请求后，一直有着建立统一蒙古国梦想的他，果真在1678年冬天集结大军出兵攻打青海。青海地区以及肃、甘、凉三州的和硕特部落闻讯也调兵驻扎在甘肃大草滩，双方大战一触即发。
此举同样惊动了清廷，康熙皇帝也命令戍边将军张勇密切观察青海局势，必要时向和硕特部提供援助。而此时喀尔喀蒙古的土谢图汗出于对噶尔丹不断扩张的担忧，也准备趁准噶尔兵力空虚的时候出兵漠西。
噶尔丹得知此消息后，为了避免与和硕特政权、清廷和喀尔喀三方同时爆发正面冲突，只得在发兵半个月后就下令班师返回漠西。但噶尔丹并不甘心，他换了个思路，既然正面攻打青藏会受到清廷和漠北喀尔喀的合击，那就采取蚕食包围战术，逐步侵入青藏地区。
1679年，噶尔丹以辉特部为先锋，攻克了察合台汗后裔统治的吐鲁番和哈密两个小国。
1681年，准噶尔大军越过天山，攻入畏无尔人居住的南疆地区，横扫叶尔羌汗国，库车、阿克苏、喀什噶尔、叶尔羌、和田等地的诸汗望风而降，噶尔丹把他们集中到首都伊犁城软禁居住。
1683年，征服了南疆的准噶尔军队开始西征，绕过天山北麓、渡过吹河，征服了安基延一带的东西布鲁特，即今吉尔吉斯斯坦。
1684年，噶尔丹再次发动西征，征服了今日乌兹别克斯坦东部的浩罕、那木干、玛尔噶朗、塔什干等城。
1685年噶尔丹第三次西征时则占领了布哈拉、撒马尔罕，其军队一直打到里海西岸。
准噶尔军队先是通过三年的南征占领了南疆的叶尔羌汗国，又是三年的西征灭掉了哈萨克汗国，自此整个南疆和西北都归于准噶尔汗国的治下。按照噶尔丹的设想，扫除了周围这些障碍之后，接下来的对手就是漠北的喀尔喀蒙古，以及盘踞在西藏的和硕特政权，拿下这两个蒙古部落后，统一蒙古高原，才能对清朝进行合围之势，与之进行最终对决，实现大蒙古国的昔日荣光。