吴石到台湾后，已是国防部参谋次长，中将军衔。成为卧底国民党高层的“密使1号”。吴石位高权重，参谋总长周至柔是其好友，“行政院长”陈诚是他的同学。
可以说是混的风生水起。而百密一疏的是冒险三个环节，代价极惨痛:
1950年2月28日深夜，国民党特务突然敲开了台湾“国防部”次长吴石的家门。
一、“老郑”叛变，朱枫暴露，双线联系让吴石浮出水面。
1949年10月和11月，我军攻打金门岛和舟山群岛失利，因此潜伏在台湾的地下党提供的情报变得尤为重要。为此，我党决定派长期在香港从事情报工作的朱枫去台湾，和吴石等人联系。
朱枫公开身份是香港人，在台湾有自己的继女和女婿，两个人当时都在警务部门工作，为她在台湾展开工作提供了掩护。
朱枫先与老郑见面，传达上级一些具体的指示；又与吴石接头，传送情报。从他手中接过全是绝密军事情报的缩微胶卷。内有：《台湾战区战略防御图》等等。
双线联系本身就意味着极大的风险。
代号老郑，名为蔡孝乾，曾参加过两万五千里长征，唯一一个台湾籍的党员。老郑的身份是台湾工作委员会的书记。地下工作的主要领导者。生活腐化，不仅暗中挪用经费来满足自己的私欲，还和自己的小姨子勾搭在一起。
1950年1月29日，蔡孝乾因为想到镇上西餐馆解馋，被一直跟踪的特务逮捕。随即叛变。供出400多名地下党人，导致台湾党组织几乎团灭。变节者活命，坚贞不屈者被押赴马场町刑场枪决。
他首先供出了朱枫，让吴石浮出水面。
蔡孝乾与吴石从未见过面，也没联系过。但是在笔记本上写有“吴次长”的字样，而吴石只与朱枫单线联系，蔡孝乾出卖吴石只是捕风捉影 ，并无实据。
然而，耐人寻味的是，吴处长的字样 如何被蔡孝乾现在笔记本上，是吴石的不够谨慎，还是朱枫的严谨？首先应该是吴石不够慎重。
不过这种捕风捉影，自然引起保密局特务怀疑。在当时风声鹤唳的形势下，无疑是一条令人亢奋的线索，这条线索会带来立功获奖晋升的机会。特务们自然不会放过。
1949年12月～1950年2月，朱枫在台湾停留了40多天，期间七次和吴石碰面，传递情报。
蔡孝乾叛变后，朱枫先是给女儿留下了信息，而后自行到一家酒店里躲避。
二、吴石帮助朱枫办理一张离开台湾的特别通行证，埋下隐患，留下实据。
在台湾切断了到香港的飞机和海上航线之后，朱枫找到了吴石，并委托吴石帮助办理一张离开台湾的特别通行证。
危急关头，吴石很有可能因为这一举动被国民党发现他的卧底身份。但是为了能够送走朱枫，吴石决定铤而走险。
吴石利用自己的身份，给朱枫签署了特别通行证，他了解到，彼时有一架军用运输机要飞往舟山，吴石决定让朱枫乘坐这架飞机。
其实，当时只要蔡孝乾出卖了朱枫，她就没有逃脱国民党特务追捕的可能。
吴石给朱枫办理特别通行证，既也有保护自身的成份，又有挺而走险的成分，舟山不是香港，仍然是蒋介石的一亩三分地。
三、吴石的家里留有一张特别通行证的副本
特务们在搜查吴石家里时，找到了一张“特别通行证”的副本，上面是陈太太（朱枫）的相关信息。
经过对比，他们发现陈太太的身份信息，而这张出境证是由吴石的副官聂曦以吴石的名义办理的。
这张特别通行证上显示，持有人的目的地是浙江舟山，这个人无疑是已经离开的陈太太。而这张出境证副本后来也成为了国民党当局对吴石定罪的直接证据。
吴石被捕后，还一度利用参谋次长的威严来恫吓审讯者，即便把证据摆在眼前，他也不会轻易承认。
后来，国民党保密局二处处长叶翔之亲自出马，负责主审。吴石所有辩解无济于事，毫无作用。
随之而来的是残酷的刑罚，吴石遍体鳞伤，右眼失明，矢志不渝；
朱枫吞金自杀未遂，宁死不屈。
1950年6月10日，我党打入国民党最高级别情报人员吴石中将，和陈宝仓中将、吴石部下聂曦上校、情报员朱枫一起被执行枪决……
