在苏共中央主动放弃领导权的情形下，苏联国内各种反共反社会主义组织纷纷成立，它们或打着“自由民主”的旗帜，或假托维护本民族利益之名，把矛头对准苏共和苏联社会主义制度，一大批亲西方人士把持舆论喉舌，公开发表大量攻击苏共历史和列宁、斯大林等领导人的作品，造成严重的思想混乱。
这种思想混乱，直接导致了党的分裂、社会的动乱和国家的解体。
一是高层思想发生严重分歧。围绕国家政权形式、改革方案等问题，戈尔巴乔夫、利加乔夫、雷日科夫叶利钦等争论激烈，形成“激进派”“保守派”“传统派”等多个派别主张。在苏共二十八大上，俄罗斯联邦最高苏维埃主席叶利钦，莫斯科市市长波波夫和列宁格勒市市长索布恰克公开退党，在全社会引发“退党潮”，共产党干部在地方苏维埃选举中纷纷落选，政权落入反对派手中。
二是各种反政府组织纷纷涌现。受政治民主化和多元化鼓励，到1990年各种非正式组织竟达9万个。这些组织大多把矛头指向苏共和苏联社会主义制度。在这些组织的煽动策划下，各地抗议示威不断，更加剧了社会动荡。
三是各种分离势力壮大。不少地方党的领导权落人民族分离主义分子手中。1989年，立陶宛共产党首先宣布脱离苏共，爱沙尼亚、拉脱维亚共产党随后也宣布独立于苏共。
苏共开始分裂。戈尔巴乔夫推行的“新思维”，对苏联军队产生了严重影响。军队中“非政治化”“国家化”思潮泛滥，军队思想政治工作的基础被釜底抽薪，在军队内部造成了深度的思想和组织分裂。为体现“新思维”，苏共在军队体制编制调整中，大幅削减各级政治机关，裁撤约8万名军队政工干部，撤销了总政治部。
苏联1990年宪法第六条的修改，从法律上剥夺了苏共对军队的最高指挥权。此后，苏军内部刮起了退党风”，特别是年轻军官大批退党。
1991年，叶利钦宣布停止苏共基层组织在军队的活动，苏共彻底失去对军队的领导权。苏共从思想上组织上放弃对军队领导的严重后果，就是这支当年为创建苏维埃社会主义国家立下汗马功劳的红军，不仅没有在社会主义制度被颠覆时起来捍卫之，而且在重要关头的倒戈加快了这个进程。
党的分裂导致民族分裂势力崛起，加速了苏联国家的分裂。继1990年3月立陶宛宣布独立后，其他加盟共和国相继发表主权宣言，要求退出苏联。以叶利钦为首的部分加盟共和国领导人，在暗中极力扩大联盟各共和国主权，动摇了苏联的根基。在国家面临解体的情况下，戈尔巴乔夫一再退让。为阻止联盟解体。
1991年8月19日，副总统亚纳耶夫等部分苏联高层领导人，借戈尔巴乔夫外出休假之机，成立国家紧急状态委员会，宣布代行总统权力，在全国实行“紧急状态”。但该事件不仅没能挽救苏联，反而加快了国家解体进程。
1991年8月24日，戈尔巴乔夫为保住总统职位宣布辞去苏共中央总书记的职务，并要求苏共自行解散。
1991年12月8日，俄罗斯、白俄罗斯、乌克兰三个加盟共和国领导人在别洛韦日森林召开秘密会议，签署《关于建立独立国家联合体的协议》，宣布苏联作为一个“国际法主体和地缘政治现实已不存在”。
1991年12月21日，以叶利钦为代表的11个主权共和国领导人在阿拉木图签署议定书，决定创建“独立国家联合体”，以取代苏联。
1991年12月25日，戈尔巴乔夫被迫辞去苏联总统职务，苏联国旗从克里姆林宫降下，苏维埃社会主义共和国联盟不复存在。